RecodeX 重构消息,英伟达公布BioNeMo推理运行时(BioIR),这是一个可在英伟达GPU上加速生物分子结构预测模型、同时保持纯PyTorch工作流的Python库。在8块H100 GPU上针对1000个人类二聚体靶点的对照基准测试中,经BioIR加速的Boltz-2每GPU小时成功折叠58.5K个残基,而经torch编译的开源实现为20.2K个,提升2.90倍。该运行时在三个层面进行优化:自定义内核选择、CUDA Graph捕获,以及基于Ray的副本扩展,每个GPU放置一份完整模型副本。BioIR已用于AlphaFold数据库扩展,在4777个蛋白质组中生成约3100万个候选蛋白质复合物。
英伟达发布BioNeMo推理运行时BioIR,Boltz-2折叠吞吐提升2.90倍
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原始信息来源Marktechpostmarktechpost.com
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